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发表于 2020-03-06 |
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医学统计学

发表于 2020-03-06 |
医学统计学第4版R语言实现 第4版 医学统计学 R语言笔记 孙振球, 徐勇勇. 医学统计学.第4版[M]. 人民卫生出版社, 2014. 章节 第二章 计量资料的统计描述 第三章 总体均数的估计与假设检验 第四章 多个样本均数比较的方差分析 第五章 计数资料的统计描述 第六章 几种离散变量的分布 ...
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单细胞分析之metacell包分析流程

发表于 2020-02-14 |
单细胞分析之metacell包分析流程 我们演示的数据集是GSE110547,可以从github中下载。 123456789101112131415161718192021222324setwd("D:\\R\\ll\\GSE110547")GSE110547<-read. ...
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tidyr包常用函数操作

发表于 2020-02-12 |
12345library(dplyr)library(tidyr)tdata <- mtcars[1:10, 1:3]tdata <- data.frame(name = rownames(tdata), tdata)knitr::kable(tdata) name mpg ...
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WGCNA实战

发表于 2020-02-12 |
基因课例子12345678910library(WGCNA)f_exp <- "sample_data/LiverFemale_Expression.txt"options(stringsAsFactors = FALSE)exp0 <- read ...
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reshape包常用函数操作

发表于 2020-02-10 |
melt 宽边长; dcast 长边宽 1234567library(reshape2)x <- data.frame(k1 = c(NA, NA, 3, 4, 5), k2 = c(1, NA, NA, 4, 5), data = 1:5)y <- data.frame(k1 ...
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dplyr包常用函数操作

发表于 2020-02-09 |
12library(dplyr)knitr::kable(dplyr::filter(iris, Sepal.Length > 7)) Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species 7.1 3.0 5.9 ...
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dnorm pnorm qnorm rnorm详解

发表于 2020-02-08 |
dnorm 返回值是正态分布概率密度函数值,比如dnorm(z)则表示:标准正态分布密度函数f(x)在x=z处的函数值.1dnorm(0, mean = 0, sd = 1) 1## [1] 0.3989423 1dnorm(0) 1## [1] 0.3989423 1dnorm(2, me ...
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DESeq2差异分析实战

发表于 2020-02-06 |
解螺旋的例子,示例数据见https://github.com/M201575478/demoData/blob/master/gene_counts.xls. 读取文件1234library("DESeq2")counts <- read.table("gene_counts.xls", se ...
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单细胞之Seurat包实战

发表于 2020-02-05 |
我们演示的数据集是E-MTAB-7704,可以从github中下载。 1. 特征描述1234567891011121314151617181920212223setwd("D:\\R\\lilei\\E-MTAB-7704")library(limma)library(Seur ...
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Xianxiong Ma

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